Как следует из проекта правительственного постановления, опубликованного на портале regulation. gov.ru, изменения разработаны в связи с пилотным переводом госпрограммы на проектное управление. Как отмечает Минсельхоз, в связи с реализацией проектного механизма госпрограмма на 2013−2020 годы должна быть прекращена и одновременно разработана новая на 2018−2025 годы, однако из-за отсутствия времени и утвержденного бюджетного прогноза осуществить это «не представляется возможным». «Таким образом, Минсельхозом России подготовлены изменения в действующую госпрограмму на 2013−2020 годы, предусматривающие переход на проектное управление с 2018 года», — отмечается в пояснительной записке.

Ранее правительство в рамках бюджетной реформы поручило перевести на проектное управление пять наиболее значимых госпрограмм (по развитию АПК, образованию, здравоохранению, жилью и транспорту) в качестве пилотных. Таким образом предполагается повысить их эффективность за счет целевого характера финансирования и четкого распределения ответственности за выполнение конкретных задач. Сейчас треть госпрограмм в стране признаны неэффективными — их цели, задачи и индикаторы слишком сложны и громоздки. Неэффективные бюджетные расходы по государственным программам Счетная палата оценивала в 2,1 трлн руб. в 2016 году и в 1,6 трлн руб. в 2015-м.

В соответствии с новой версией госпрограммы АПК ее финансирование из федерального бюджета, как и предполагалось, в 2018 году составит 241,3 млрд руб., в 2019—2020 годах — по 242,2 млрд руб. В действующей версии госпрограммы объем бюджетных ассигнований установлен на уровне 200 млрд руб. на 2018 год и по 194,1 млрд руб. на 2019 и на 2020 годы, однако в проекте федерального бюджета на ближайшие три года, принятого Госдумой 27 октября в первом чтении, финансирование АПК на следующий год заложено в объеме 222,3 млрд руб. При этом президент Владимир Путин поручил правительству увеличить эту сумму еще на 20 млрд руб., чтобы объем господдержки был сохранен на уровне 2017-го (242 млрд руб.).

В новой редакции программы сформулированы пять основных целей. Первая — это обеспечение продовольственной безопасности, которому должен способствовать рост производства продукции АПК в 2018 году на 6,6% к уровню 2015-го, а к 2020 году — на 10,8%. Вторая — достижение значения произведенной добавленной стоимости, создаваемой в сельском хозяйстве, в 2020 году в объеме 4,05 трлн руб. против 3,2 трлн руб. в 2015-м. Кроме того, к этому времени экспорт продукции АПК должен вырасти на 32% к уровню 2015-го (в том числе в 2018-м — на 17%), физический объем инвестиций в основной капитал сельского хозяйства — на 13,1%, а объем располагаемых ресурсов домашних хозяйств в сельской местности достичь не менее 18,3 тыс. руб.